摘要這次停駛發生在強震之後，鐵道運行受到明顯衝擊。熊本縣八代市一帶在29日仍可見JR九州列車停在鐵軌上，顯示地震後鐵路系統需要時間確認設備、路線與行車安全
JR九州宣布，因地震影響而停駛的九州新幹線筑後船小屋至熊本路段，將於31日上午恢復營運。恢復後列車不會立即回到平常班表，而是以每小時約1至2班的頻率行駛，並採取各站停靠方式，讓熊本以北區間先行恢復基本交通功能。
熊本以北先行恢復有限班次
這次停駛發生在強震之後，鐵道運行受到明顯衝擊。熊本縣八代市一帶在29日仍可見JR九州列車停在鐵軌上，顯示地震後鐵路系統需要時間確認設備、路線與行車安全，部分列車也因此無法立即恢復正常調度。
依JR九州公布的時刻，31日恢復行駛後，上行首班列車將於上午6時8分自熊本站出發，目的地為博多；下行首班列車則預定上午6時42分從博多站開往熊本。相關安排意味通勤、返家與轉乘旅客可先在熊本以北路段恢復搭乘，但仍須留意班距較平時稀疏。
直通山陽與南段服務仍停駛
JR九州同時說明，九州新幹線與山陽新幹線之間的相互直通運轉目前仍暫停。也就是說，雖然筑後船小屋至熊本間重啟部分服務，旅客若原本規畫跨越九州與山陽新幹線直通搭乘，仍需依現場或最新時刻安排調整行程。
另一個仍未恢復的區段，是熊本至鹿兒島中央路段。JR九州指出，該區間受地震影響，修復作業仍需要時間，因此31日仍將全天停駛，至於何時可以重新通車，目前尚未確定。
從目前運行安排來看，九州新幹線是以分段、有限班次方式逐步恢復。熊本以北先行通車可減輕部分交通壓力，但南下鹿兒島中央方向與跨線直通需求仍受限制，旅客在出發前仍須確認班次、停靠方式與可銜接路段，以免抵達車站後受到停駛或改點影響。
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